Элай со времён колледжа был нанят Бенджамином Локвудом в качестве контролёра и финансового директора его Поместья, а при случае смерти Локвуда он должен был продолжать давать жить капиталам Локвуда. Бенджамин выбрал Миллза, так как он был молодым и амбициозным.
В 2010-2011 году Элай впервые встретил Клэр Диринг.
Элай узнаёт о планах Бенджамина спасения динозавров с острова на заповедник, но намеревается переделать все планы в целях "направления капиталов в будущее" засчёт продажи динозавров в военных целях. Он финансирует прибывшего из разрушенного Мира Юрского периода Доктора Генри Ву в подземной лаборатории Поместья Локвуда и под впечатлением тренированных рапторовОуэна Грейди и Индоминуса Рекса принимает инициативу InGen в продаже динозавров-оружий, управляет Генри с его созданием индораптора, очень опасного, но обучаемого хищника, на что Ву требуется ДНК Индоминуса Рекса и велоцирапторБлю.
После оповещения в 2017 году о том, что вулкан на Нубларе активировался, Элай от лица Бенджамина отправляет Кена Уитли и его отряд на Исла Нублар, командуя ему поймать как можно больше динозавров. В какой-то момент Миллз связался с аукционистом Гуннаром Эверсолом, назначая встречу.
Когда Клэр Диринг по вызову Бенджамина Локвуда прибывает в его Поместье, Элай Миллз напоминает ей, что работает на Бенджамина Локвуда и выслушивает вместе с ней слова Локвуда об острове-заповеднике. Элай говорит, что можно спасти особей 11 видов или даже больше и подмечает, что операция не совсем законная. Он также рекомендует Клэр привлечь Оуэна к делу, чтобы тот увёз с острова единственного велоцираптора на острове - Блю, причём, судя по словам самого Грейди, Миллз сам связывался с Оуэном.
Во время извержения вулкана на острове Кен Уитли сообщает, что Блю была поймана, из-за чего он требует премии, на что Элай командует ему перевезти животных как можно скорее к Поместью, так как к нему уже прибыл Эверсол, который ожидает продажи животных, которые ещё не на месте. Миллз говорит, что динозавры прибудут завтра, и рассказывает Гуннару о том, что деньги с аукциона - лишь финансирование гораздо более прибыльных продаж с участием генетических манипуляций в военных целях вроде индораптора, чей прототип Миллз показывает Эверслоу.
На следующий день Миллз докладывает доктору Ву о Блю, которая была подстрелена, о чём Генри забеспокоился, ведь, чтобы будующий индораптор был послушен, ему необходима Блю как поведенческий образец, и создание индораптора - уже новый шаг в науке, а его воспитание без Блю вообще может не удасться. В итоге Элай просто сказал Ву, если он способен это сделать, тогда он сделает это. После Элай обнаруживает Мейзи у клетки с прототипом индораптора и запирает её в комнате, чтобы она не доложила об этом кому не надо, и сказал Айрис не выпускать её.
Бенджамин Локвуд в итоге узнаёт о торговле спасённых животных от сбежавшей Мейзи и приказывает Миллзу позвонить и сообщить полиции о происходящем, но Элай думая, что делает всё как надо, душит Локвуда подушкой до смерти. Затем Миллз идёт встречать с Эверсолом покупателей аукциона у входа в Поместье. Он сообщает Айрис о том, что теперь она тут не работает по его праву.
По поимке в клетку Оуэна и Клэр Элай сочувствует о том, что Клэр в это попала. Миллз говорит, что спасает пойманных динозавров, намекая, что покупатели животных смогут их клонировать. Элай говорит, что Клэр, одобрившая создание Индоминуса рекса, и Оуэн, дрессировавший рапторов, родители нового мира, и чуть не получает перелом руки от Грейди, удар прутьям клетки в лицо от Диринг и разбитые очки. Уитли спрашивает, что делать с парой, и Элай говорит, что все должны думать, что Клэр и Оуэн сгорели на острове, поэтому их следует не отпускать.
Во время начавшегося аукциона Элай смотрит на счётчик заработанных на динозаврах денег и становится очень довольным. Во время презентации Прототипа индораптора Миллз, слыша как покупатели хотят его приобрести, но понимая, что это тот не полностью функционален, не собирается его продавать, но, слыша какие цены за него назначают, кардинально меняет своё решение и даёт добро на продажу животного.
После того, как аукцион начала громить Стигги и сбежавший Оуэн, Миллз приказал охране увезти клетку с прототипом индораптора к тому, кто купил животное, затем побежал за охраной.
После погрома Миллз встретил с охранниками Оуэна, Клэр и Мейзи, и, чтобы они отказались от Локвуд и отпустили её к нему, сообщил им, что Мейзи на самом деле клон дочери Бенджамина, а не его внучка. После того, как вырвавшийся прототип индораптора унёс обоих охранников на глазах Элая, он трусливо убежал.
Генри Ву передаёт Элаю кусок скелета Индоминуса Рекса, чтобы тот отвёз его в безопасное место, что и собирается сделать Миллз, но видя, как из Поместья на улице к нему и его машине бежит освобождённое стадо динозавров, прячется под машиной, где чуть не раздавливается. Буря от животных стихла, и он выходит из-под машины, но тут его хватает тираннозаврРекси, разрывает и съедает вместе с карнотавром.
Прочее
Миллз неправильно назвал Джона Хаммонда как "Джон Альфред Хаммонд", в то время как его настоящее имя - "Джон Паркер Хаммонд".
Также Элай соврал, что не знал об имении имени Блю.
Изначально Миллз не упомянал об Исла Сорне в его разговоре с Клэр, и об острове зритель должен был услышать через новости BBC, в особенности, о том, что к нему ограниченный доступ, и что он заброшен.
В удалённой сцене Элай Миллз и Гуннар Эверсол разговариваривают рядом с неосвещенной клеткой прототипа индораптора, который играется с человеческим черепом. Миллз рассказывает про техника, который должен был восстановить внезапно потухший свет в клетке, но двух дротиков транквилизатора для гибрида оказалось недостаточно. В итоге череп бедняги стал игрушкой для индораптора, а клетка так и осталась во мраке. Просмотрев запись с видеокамеры выяснилось, что освещение испортил сам гибрид подобно его предшественнице индоминусу рексу, которая расцарапала стену в своём загоне. Дослушав историю, Эверсол разглядывает прототип индораптора в клетке и говорит, что покупатели должны его видеть.
Судя по его словам о Мейзи: "Я понимаю её ценность", Элай мог планировать продать её в будущем, так как не видел в ней человека.
Смерть Миллза очень похожа на смерть Питера Ладлоу, которого съел тираннозавр, и Эдди Карра, которого разорвали два тираннозавра.
